Efektīvai Nodokļu un muitas policijai deleģēto funkciju izpildei saistībā ar noziedzīgu nodarījumu muitas jomā atklāšanu un novēršanu Nodokļu un muitas policijai ir kompetence veikt muitas kontroli precēm atbilstoši Savienības muitas kodeksa prasībām, tai skaitā:
- izmantot Savienības muitas kodeksā nostiprinātas muitas iestādes tiesības veikt preču pārbaudi
- paraugu ņemšanu
- deklarācijā vai paziņojumā ietvertās informācijas pareizības un pilnības pārbaudi
- dokumentu esības, īstuma, pareizības un derīguma pārbaudi
- uzņēmēju grāmatvedības un citu uzskaites datu pārbaudi
- transportlīdzekļu apskati
- personu nestās vai vestās bagāžas un citu mantu pārbaudi un citas līdzīgas darbības
Nodokļu un muitas policijai ir tiesības veikt muitas kontroli visā Latvijas Republikas muitas teritorijā, tajā skaitā:
- apturēt transportlīdzekli un veikt tā apskati, ja ir pamats aizdomām, ka transportlīdzeklis tiek izmantots likumpārkāpuma izdarīšanā muitas lietu jomā
- apturēt transportlīdzekli muitas kontroles veikšanai visā Latvijas Republikas muitas teritorijā un nogādāt transportlīdzekli muitas iestādē muitas kontroles veikšanai atbilstoši normatīvajiem aktiem muitas jomā
- sagatavot pārbaudes aktus un citus dokumentus par veiktajām muitas kontroles darbībām
- veikt personas pārmeklēšanu muitas kontroles laikā
